第一，人心不齐，治理意识不强。
第二，环境质量差，村民没有养成良好的环保意识。
第三，乡村河流污染严重，屡禁不止。
第四，乡村活力不强。
农村人口“空心化”是乡村治理的突出难点农村集体经济薄弱导致“无钱办事”治理机制的不健全，存在“力量弱”“管理乱”等问题。
乡村治理的困境一：城镇化的浪潮下，空心村现象严重
改革开放以来，中国城镇化的速度加快，截止到目前中国城镇化率已达到60%以上，城镇化浪潮下，带给乡村的问题则日益突出，越来越多的农村人口转移到城镇，导致空心村现象严重，空心村带来的留守老人和儿童的问题较为突出，农村房屋空置率高，农村基础设施差，医疗和教育水平都赶不上，越来越多的人涌入城镇，规模性城镇居民增加，乡村慢慢消亡。
解决办法：实行合村并镇（合村并点），将农村稀少的人口聚集在一起，统一管理，优化农村资源配置，改善居住环境，提高人们的生活水平，节约利用土地资源，但是合村并点工作一定要充分吸纳老百姓的意见，尊重老百姓的选择，给出合理的搬迁条件等。
乡村治理的困境二：治理中心在于解决人、地、钱等问题
城镇化农村人口转移带来的最直接的问题就是农村人口减少，土地无人耕种，农村就业机会少，农民收入增加困难等等。大量的劳动力转移到城市，最直接的影响是农村人口集聚减少，越来越多的农村人定居到城市，导致土地无人耕种，农村市场萧条，经济孱弱，农民增收困难。